Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SftpdP50404 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SftpdP50404 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms