Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbrP50284 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms