Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms