Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms