Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh1P48985 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh1P48985 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms