Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms