Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn3P48299 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edn3P48299 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms