Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl29P47915 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms