Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrprbP47758 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrprbP47758 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SrprbP47758 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms