Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax7P47239 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax7P47239 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax7P47239 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax7P47239 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms