Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf4P43488 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms