Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6a1P43024 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms