Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-5P42582 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-5P42582 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms