Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elk1P41969 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elk1P41969 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms