Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Chd1P40201 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd1P40201 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd1P40201 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms