Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf2P39429 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms