Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf1P39428 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms