Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col18a1P39061 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col18a1P39061 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms