Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig1P37913 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms