Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpargP37238 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpargP37238 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpargP37238 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpargP37238 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpargP37238 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpargP37238 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpargP37238 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms