Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh15P33146 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh15P33146 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh15P33146 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh15P33146 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh15P33146 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh15P33146 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh15P33146 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh15P33146 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh15P33146 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh15P33146 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms