Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PvalbP32848 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PvalbP32848 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms