Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SsbP32067 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SsbP32067 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SsbP32067 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SsbP32067 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SsbP32067 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SsbP32067 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SsbP32067 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SsbP32067 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SsbP32067 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SsbP32067 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SsbP32067 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms