Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f3P31361 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f3P31361 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f3P31361 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms