Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc11P31313 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms