Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnd3P30282 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms