Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msr1P30204 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms