Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa3P28310 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa3P28310 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa3P28310 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms