Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb1P28230 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb1P28230 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb1P28230 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb1P28230 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms