Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lef1P27782 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lef1P27782 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms