Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl3P27659 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms