Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna1P26231 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms