Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RdxP26043 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RdxP26043 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RdxP26043 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RdxP26043 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RdxP26043 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RdxP26043 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms