Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gja1P23242 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja1P23242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms