Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RarbP22605 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RarbP22605 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RarbP22605 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RarbP22605 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RarbP22605 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RarbP22605 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RarbP22605 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RarbP22605 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RarbP22605 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RarbP22605 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RarbP22605 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RarbP22605 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms