Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms