Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SftpcP21841 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpcP21841 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpcP21841 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SftpcP21841 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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