Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a2P20490 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms