Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms