Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefhP19246 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefhP19246 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefhP19246 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NefhP19246 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefhP19246 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefhP19246 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefhP19246 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NefhP19246 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefhP19246 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms