Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms