Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa-rs1P17533 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms