Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms