Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms