Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp53P15975 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp53P15975 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp53P15975 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp53P15975 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp53P15975 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms