Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms