Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spp1P10923 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spp1P10923 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spp1P10923 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms