Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ndufb1P0DN34 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ndufb1P0DN34 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ndufb1P0DN34 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ndufb1P0DN34 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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