Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms