Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wipf3P0C7L0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms